1、禁用快速关机
快速关机是Windows 98中的新增功能，可以大大缩短关机时间。但是，该功能与某些硬件不兼容，如果安装了这些硬件，可能会导致计算机停止响应。禁用快速关机的操作步骤是：
①"开始/运行"，在输入框中键入"msconfig"，然后单击"确定"；
②单击"高级"，选中"禁用快速关机"复选框，单击"确定"，再击"确定；
③重新启动计算机后再关机，如果计算机正常关闭，则说明快速关机功能与计算机上所安装的某些硬件设备不兼容，可与设备销售商联系。 2、检查"高级电源管理（APM）"功能
①单击"开始/设置/控制面板/系统"；
②在"设备管理器"选项上双击"系统设备"；
③双击设备列表中的"高级电源管理"，单击"设置"选项卡，然后清除"强制使用APM方式"前的"√"并确定；
④重启计算机后如能正常关机，则问题的原因可能在于APM。应关闭高级电源管理功能。
3、检查是否是退出时的声音文件被破坏
打开"控制面板"中的"声音"，在事件表中，单击"退出Windows"项。在"名称"栏，选择"无"，再按"确定"以保存设置。关闭系统看能否正常退出，如果能正常退出，则应更换声音文件。
4、利用Boot.txt文件确定故障
利用Boot.txt文件有助于确定无法正常关机的故障原因。使用文本编辑器，如"记事本"，打开Bootlog.txt文件，检查Bootlog.txt文件中的Terminate=条目。这些条目位于文件的结尾，可为问题的起因提供一定的线索。
如果Bootlog.txt文件的最后一行为EndTer-minate=KERNEL，Win98就可成功关闭。如果最后一行为下列某项条目，请检查所列出的可能原因：
Terminate=QueryDrives 内存管理程序有问题；
Terminate=UnloadNetwork 与Config.sys中的实模式网络驱动程序冲突；
Terminate=ResetDisplsy 可能需要更新视频驱动程序；
Terminate=RIT 声卡或鼠标驱动程序存在与计时器有关的问题；
Terminate=Windows32 与32位程序有关的问题阻塞了线程。
其它原因
计算机出现启动或关闭故障，除了上面常见的原因之外，还有可能是其它原因造成，可以使用Msconfig（系统配置程序）来逐个检查。
1、Config.sys文件或Autoexec.bat文件中存在冲突
确定Config.sys文件是否存在问题：运行Msconfig，在"常规"选项卡中，单击"选择性启动"，清除"处理Config.sys文件"以外的其它项目复选框的"√"，单击"确定"，并重新启动计算机。如果计算机无法正常启动或关闭，则说明Config.sys文件中的条目存在问题。可再运行"Msconfig"，选择"Config.sys"标签，清除Config.sys选项卡中所有不含Windows图标行的选钩，然后只启动某行，单击"确定"，如果计算机的启动和关闭都很正常，再启用另一行，重复以上步骤直至确定故障原因。确定引发问题的条目之后，可通过Msconfig取消或修改该项，也可直接删除或修改Config.sys文件中的此条目。检查、调整Autoexec.bat文件的方法与Config.sys相似，不再赘述。
2、SYSTEM.INI和WIN.INI文件中的条目不正确
用上面的方法也可以确定System.INI和Win.INI文件中是否存在冲突，并可通过Msconfig取消或修改该项。也可直接删除或修改System.ini文件中的此条目